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预印本称AlphaGenome低估因果变异效应

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AI 综述

Gladstone研究所的Shiron Drusinsky与Katherine Pollard发布bioRxiv预印本,称AlphaGenome系统性低估多数因果变异效应,其因果变异精细定位表现不及线性基线。该模型在分类疑似因果的eQTL SNV上表现尚可,但按全基因组序列排序个体基因表达值时显著落后,邻近的非因果变异会随机主导预测。 两位作者认为,这一现象与LD无关;相关结论目前来自预印本,尚未经同行评议。

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报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月30日
  1. AGI Hunt
    UCSF 论文:AlphaGenome 系统性低估因果变异效应,精细定位表现不及线性基线

    一项 UCSF 相关 bioRxiv 预印本指出,AlphaGenome 系统性低估多数因果变异效应,因果变异精细定位表现不及线性基线。该模型在分类疑似因果的 eQTL SNV 上表现尚可,但在按全基因组序列排序个体基因表达值时显著落后,邻近非因果变异会随机主导预测。作者认为这一现象与 LD 无关。

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