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UMass发布BATv1转录因子图谱

2 篇报道1 个报道来源2 小时前更新

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AI 综述

UMass Chan医学院可编程基因组学实验室发布Cherimoya Binding Atlas(BATv1),收录17,145个对应ENCODE单一转录因子结合ChIP-seq实验的预测模型,覆盖3,429个实验、183种生物样本和1,139个靶点。报道称,单模型约4.6万参数,显著小于CATv1和BPNet,但精度超过BPNet。 模型可按需下载,采用CC-BY-4.0许可并公开代码;每个模型均通过5折染色体留出交叉验证训练和评估,分别报告验证集与测试集染色体的表现。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

10月31日
  1. AGI Hunt
    UMass Chan 医学院发布 Cherimoya Binding Atlas BATv1:收录 17,145 个模型

    UMass Chan 医学院可编程基因组学实验室发布 Cherimoya Binding Atlas(BATv1),汇集 17,145 个 Cherimoya 模型,覆盖 ENCODE 的 3,429 个转录因子结合 ChIP-seq 实验。单个模型约 4.6 万参数,模型规模显著小于 CATv1 的约 61.4 万参数和 BPNet 的约 11.4 万参数,但精度超过 BPNet。

  2. AGI Hunt
    UMass 团队发布 Cherimoya Binding ATlas(BATv1):构建 3429 个转录因子 ChIP-seq 模型图谱

    UMass Chan 医学院可编程基因组学实验室发布 Cherimoya Binding ATlas(BATv1),提供 17,145 个覆盖 3,429 个转录因子 ChIP-seq 实验的预测模型。

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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。