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TurboPairFormer开源加速OpenFold3

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AI 综述

Lambda、Stevens理工学院与OpenFold团队发布开源GPU内核TurboPairFormer,通过优化OpenFold3中计算复杂度较高的triangle attention,使每个优化器步骤相较原Triton后端最高提速1.73倍。 该内核面向蛋白质结构模型微调场景,支持H100/H200;在H200运行768 pixel输入时,每步耗时由22.53秒降至14.67秒,提速1.54倍。固定输入测试显示,600组测试中的Q、K、value和pair-bias四类梯度均与参考实现逐位一致。

AI 根据报道生成 · 48 分钟前更新

报道时间线

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11月14日
  1. AGI Hunt
    TurboPairFormer 开源 GPU 内核将 OpenFold3 训练提速最高 1.73 倍

    Lambda、Stevens 理工学院与 OpenFold 团队发布开源 GPU 内核 TurboPairFormer,将 OpenFold3 训练提速最高 1.73×。

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