sokrypton谈小分子领域复制AlphaFold的数据需求
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sokrypton谈小分子领域复制AlphaFold的数据需求
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AI 综述
ESMFold作者sokrypton提出,小分子领域若要复制AlphaFold式的成功,需要在整个生命树上收集与蛋白质基因组学、宏基因组学数据规模相当的配体数据,以利用进化协变信息缩小蛋白质—配体结合预测的搜索空间。 他认为,这类AI4Science方法的目标不是彻底解决问题,而是借助约40亿年的进化历程这一“最伟大的实验”,为预测提供约束。
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最新进展11月4日 22:10
ESMFold 作者 sokrypton:小分子领域复制 AlphaFold 需收集全生命树级配体数据报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月4日
- AGI HuntESMFold 作者 sokrypton:小分子领域复制 AlphaFold 需收集全生命树级配体数据
ESMFold 作者 sokrypton 在关于蛋白质-配体结合预测搜索空间过大的讨论中提出,小分子领域要复现 AlphaFold 式成功,需借鉴其利用进化协变信息的思路,在整个生命树上收集与基因组学/宏基因组学对蛋白质同等量级的配体数据。他强调这类 AI4Science 方法的目标不是彻底「解决」问题,而是利用 40 亿年进化这一「最伟大的实验」来缩小搜索空间。
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还没有足够的连续观测数据,暂不绘制趋势。