斯坦福团队开源SMFNet离散扩散模型
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斯坦福团队开源SMFNet离散扩散模型
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AI 综述
斯坦福大学Anshul Kundaje实验室以MIT协议开源SMFNet官方实现，以2048个碱基对的DNA序列为输入，生成中心1024个碱基对区域的单分子足迹读段分布，并逐个位点标注分子受保护或可及。 模型可使用三类实验数据训练，其中包括含CpG或GpC甲基酶的Nanopore单分子足迹数据。其采样结果可呈现序列所编码的分子状态范围，而非仅反映平均可及性。
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最新进展11月6日 03:16
斯坦福团队开源 SMFNet：离散扩散模型生成单分子足迹测序读段报道时间线
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11月6日
- AGI Hunt斯坦福团队开源 SMFNet：离散扩散模型生成单分子足迹测序读段
斯坦福团队以 MIT 协议开源 SMFNet 实现，以 2048bp DNA 序列为输入，生成中心 1024bp 区域的单分子足迹（SMF）读段分布。模型可逐位点标注分子保护或可及状态，支持三类实验数据训练，包括含 CpG/GpC 甲基酶的 Nanopore SMF。大量采样读段可呈现序列编码的分子状态范围，不只反映平均可及性。
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