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基因组机器学习推出GPU直载文件格式

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AI 综述

一位开发者介绍了一种面向基因组机器学习的新文件格式,可由GPU直接加载,并兼容JAX与PyTorch,用于避免现代机器学习工作流中的数据转换和传输负担。 该格式覆盖bigwig的多分辨率zoom能力,支持任意数据类型,并可沿前两维任一方向稀疏存储。针对单细胞或分子数据,它还能按聚类提取pseudobulk,以适配不同分析任务。

AI 根据报道生成 · 55 分钟前更新

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10月28日
  1. AGI Hunt
    基因组 ML 新文件格式:GPU 直载且兼容 JAX 与 PyTorch

    一位开发者介绍了一种面向现代基因组机器学习的新文件格式,覆盖 bigwig 的全部能力,并支持 GPU 直接加载及 JAX、PyTorch。该格式提供多分辨率 zoom、任意数据类型,以及可沿前两维任一方向进行稀疏存储;针对单细胞或分子数据,还可按聚类提取 pseudobulk。

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