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蛋白质界面评分横评:ipDAE稳定,组合方法领先

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AI 综述

btnaughton 对折叠模型蛋白质结合界面的 ipSAE、ipDAE 和 ipTM 评分方法进行对比。结果显示,ipDAE 在多组评测中保持 77.5%—80% 的阳性预测值(PPV),OpenDDE+ipTM 组合以 80% PPV 达到单模型组合最高水平,且在不同阈值下表现稳健;ipSAE 整体偏弱。 评测使用 200 个实验测定的结合物、200 个非结合物,覆盖28个靶点和3种结构预测器,并按各方法得分前10%计算PPV。共识方法的表现反而仅提升至72.5%—75%,未超过最佳单模型组合。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

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10月31日
  1. AGI Hunt
    蛋白质结合评分横评:ipDAE 稳定领先,OpenDDE+ipTM 意外强劲

    蛋白质结合界面评分横评显示,ipDAE 整体稳定保持 77.5–80% 的 top 10% PPV,OpenDDE+ipTM 以 80% PPV 达到单模型组合最高水平。评测覆盖 200 个结合物、200 个非结合物、28 个靶点和 3 种结构预测器;OpenDDE+ipTM 在不同阈值下均表现稳健,而共识仅提升至 72.5–75%,ipSAE 整体偏弱。

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