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MACS3 v3.1.0提升峰检出效率

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AI 综述

MACS3发布v3.1.0,新增由Jacob Schreiber贡献的auto-optimize、CPU线程控制和执行策略选项,并修复control样本重复过滤问题。据8核环境三次运行取中位数的基准测试,callpeak在BAM、FRAG、带control的BAM和BAMPE输入上分别提速41倍、64倍、49倍和57倍。 实际增幅取决于工作负载:短任务改善有限,大型输入可能占用更多内存。

AI 根据报道生成 · 2 小时前更新

报道时间线

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10月22日
  1. AGI Hunt
    生信工具 MACS3 发布 v3.1.0,auto-optimize 将 callpeak 提速 41-64 倍

    生信工具 MACS3 发布 v3.1.0,Jacob Schreiber 贡献的 auto-optimize 工作将 callpeak 速度提升 41-64 倍。

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