自主 Agent 定制 MSA 策略，提升 AlphaFold 3 蛋白复合物预测

上海交大联合复旦、北邮及上海人工智能实验室的团队提出自主研究 Agent，通过定制 MSA 组织方式提升 AlphaFold 3 的蛋白-蛋白界面预测效果。该 Agent 将冻结的 AlphaFold 3 视为黑盒实验平台，基于生物学假设推理并自主设计针对特定目标的 MSA，以更少的序列实现更准确预测。