ProteinMPNN 跨膜蛋白记忆假说与加噪“越狱”机制讨论

sokrypton 与 @DdelAlamo 讨论 ProteinMPNN 可能记住跨膜蛋白并需重训排除的机制。他们推测，在 0.3 噪声设置下，模型不再将蛋白识别为跨膜类型；具体实现或涉及调节不同氨基酸的偏置，或利用跨膜与可溶蛋白的平均激活值修改权重。